大堂：審理案件情境
大堂以清朝衙署規制說明為治事之所，主要為總兵官審理案件之處，後因不同單位進駐整修，形成如今的空間狀態。
左右為令牌及其架子，主要說明官階級及官名，左右靠牆則展示高度較高之兵器與旗幟，
主持審判
金門暨總兵署歷史
由於清代總兵官與金門過往歷史及海上地理位置息息相關，相輔相成，本區從金門歴史及地理位置切入，說明歷代人口流動，官衙設置、總兵歷史及故事、清朝武職階序等。
總兵生活體驗區
藉由總兵署建築物及其規制，輔以家具及蠟像等重現總兵生活情境，使遊客能更加身歷其境。
主題展示區
藉由總兵署建築物及其規制，輔以家具及蠟像等重現總兵生活情境，使遊客能更加身歷其境。
清金門總兵署特展
開放時間 上午10:00-晚間10:00
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